一、种公的选择：
就藏獒这一物种而言，幼崽继承父系基因的比例会略大于母系基因，所以在种公獒的选择上一定要理性、谨慎。我们应当选择身体健康、体形高大、外貌上乘、情绪稳定、躯体健壮、毛色纯正、生殖器正常、性欲旺盛、遗传基因稳定的公獒作为种公獒。
需要注意的是，并不是所有的性欲旺盛的公獒都是生殖健康獒。以隐睾公獒为例，一般的隐睾公獒是有正常的性欲的。不可用隐獒公獒作为种用的原因是：隐睾獒的睾丸完全或部分未外露，长期置于其体内，由于体内的温度过高，导致睾丸内的精液中的精子多为死精，剩余精子的活跃性也比较差，这样的精子很难与母獒的卵子正常结合，受孕率低！所以我们在辨别一只种公獒（尤其是在之前从未用于种用的）是否是生殖健康獒的时候，要进行仔细的观察。
杂交是一种必须要去杜绝的错误行为，为了追求幼崽的某些局部特征而进行杂交，是对藏獒这一物种的根本性伤害！即使达到了幼崽的局部体貌特征优化的目的，但该犬只的血统与谱系是完全混乱的，这种做法不仅违背了遗传原则，还会导致犬只会失去原有的基本特性！除此之外，三代内的近亲交配及横配也是错误的行为。所有的哺乳动物都是适用“同种内远系基因优化法则”的，关于近亲交配可以使母獒生产出优秀獒崽的说法是没有任何科学根据的。
二、交配知识
自然交配可以使公獒养成自行、主动交配的良好习惯，自然交配也可以帮助人工养殖藏獒逐渐恢复原生特性。所以从科学角度上讲，我们是提倡藏獒进行自然交配的。
如果遇到公母獒体型相差较大，公獒胆小、性欲低等情况，致使公母獒间不能完成自然交配，就需要进行人工辅助交配。有些母獒可能会在配种期间表现的非常神经质，当公獒与它靠近的时候，它可能会对公獒进行攻击，此时，亦需要进行人工辅助交配。（辅助交配的工作人员最好是这只母獒的专职饲养员，如若不是，就一定要由专职饲养员为母獒佩带好口笼，以免其攻击到辅助交配的工作人员。）
在母獒发情的时候，一定要检查好每间獒舍的门锁，母獒在发情期间会散发出一种引起公獒性欲的气味，如果母獒离开了獒舍，就有可能吸引到某只公獒与其形成自然交配，破坏獒主原本的配种计划。
下面我们就给大家介绍一些比较常用且应用起来比较简单的人工辅助配种的方法。
1、公母獒体况相差较大
辅助人员蹲在母獒左后侧，左手抓住母獒尾巴和左后肢膝部，右手握住母獒的外阴，根据阴茎插入的角度适当使母獒外阴上下调整，使公獒的阴茎与母獒的阴道处于同一水平位置，形成“空间对位”，直至配种成功。母獒体小，公獒体大时，应在配种场中选择一凸凹处，使母獒后肢站在凸处，也可在配种场平地上铺垫一块厚木板，令母獒后肢站在其上，固定不动后再令公獒交配，体况相差过大的，还要用手或左膝托着母獒的后躯，使其不至于被压倒。反之，若公獒体小，母獒体大时，将母獒固定于凹处或垫块木板使公獒站高，保证其空间对位。
在进行这种方式的辅助工作时，辅助工作人员注意自己是在“帮、托”，而不是控制，要注意手法和力量。
2、公獒胆小或性欲较低
对于胆量小的公獒，一是将待配母獒放入公獒舍内，公獒在自己舍内一般情况下具有相对较高的性欲；二是先将公獒牵到非常安静的配种场内，然后将母獒牵入配种场，四周不要有人围观，这样就能顺利完成交配。对于性欲较低的公獒，在配种前，令母獒站立不动，辅助人员牵拉公獒在母獒四周走动，并使其嗅到发情母獒的特殊气味，等其对母獒感兴趣时，再牵拉公獒到母獒身边，在公獒舔母獒外阴时，将母獒慢慢拉走，以激起公獒的性欲；对有爬跨母獒行为，但性欲不高的公獒，在其爬跨时，牵制一下公獒，使其空爬几次，引发其性欲。一次配种经过几次试探，均未成功时，应先让公獒休息一会，然后移动母獒位置，激发公獒性欲。同时，对于胆小、性欲低的公獒要加强锻练，及时查找性欲低下的原因。
配种知识